40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5949 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  38.14 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  38.12 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 344 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  33.07 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  34.73 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  34.73 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  34.31 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  36.21 
 
 		 299 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  35.43 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  33.91 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  35.61 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  31.49 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  34.68 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  33.33 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  30.51 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  32.47 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  32.03 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  34.36 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  30.24 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  28.93 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  29.51 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  27.71 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  35.58 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  28.21 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.1 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  29.72 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  28.65 
 
 		 342 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  28.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 		 197 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 		 210 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.4 
 
 		 213 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>