More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5946 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  39.02 
 
 
215 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  39.9 
 
 
214 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  36.02 
 
 
234 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  35.68 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  34.32 
 
 
259 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  37.13 
 
 
219 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  38.61 
 
 
224 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  36.67 
 
 
211 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  36.74 
 
 
229 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.82 
 
 
226 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  34 
 
 
209 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  34 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  35.59 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  36.55 
 
 
229 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  36.55 
 
 
229 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
211 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.05 
 
 
225 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
196 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  38.54 
 
 
215 aa  104  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  29.77 
 
 
234 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.77 
 
 
234 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  29.3 
 
 
235 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 
199 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  26.58 
 
 
262 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  33.54 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  34.57 
 
 
199 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.06 
 
 
827 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  33.17 
 
 
832 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  29.7 
 
 
825 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.1 
 
 
819 aa  88.6  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  34 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.5 
 
 
208 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.85 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  29.85 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  35.32 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.09 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  28.08 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  28.71 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  34.74 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  28.08 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  28.21 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  27.09 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  27.09 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  24.77 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.91 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.32 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.7 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  26.11 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  28.29 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  29.5 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  32.14 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  26.48 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.21 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  28.79 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.21 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  29.8 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  31.45 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  25.94 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  28.27 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.22 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  28.02 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  29.58 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  28.27 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.16 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.19 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  28.27 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  26.44 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  34.25 
 
 
290 aa  75.1  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  28.22 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  30.11 
 
 
962 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  30.11 
 
 
974 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  28 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  26.18 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1118  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  28 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182944  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  29.57 
 
 
950 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  24.4 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  27.44 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  29.47 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  26.13 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  28.19 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  34.72 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  26.64 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  24.4 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.25 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  25.45 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  32.64 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>