42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5898 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  80.75 
 
 		 239 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  54.17 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  54.17 
 
 		 243 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  53.75 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  51.46 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  46.86 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  44.4 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  44.77 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  43.28 
 
 		 544 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  35.37 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  31.22 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  32.33 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  31.47 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  33.87 
 
 		 248 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  35.42 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  34.04 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  33.91 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  30.6 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  32.33 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  27.63 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  26.53 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  31.75 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.81 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  29.53 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  38.57 
 
 		 70 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  28.12 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  27.23 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  27.23 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  28.22 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  27.32 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  27 
 
 		 415 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  22.73 
 
 		 484 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  30.06 
 
 		 389 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  28.16 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  27.18 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  27.71 
 
 		 400 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>