179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5828 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  70.5 
 
 		 200 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  50.25 
 
 		 216 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  51.02 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  50 
 
 		 213 aa  191  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  49 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  51.27 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  48.45 
 
 		 874 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  48.72 
 
 		 877 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  34.9 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  28.42 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  28.27 
 
 		 962 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  27.27 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  28.27 
 
 		 974 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  28.27 
 
 		 950 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  26.59 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  28.8 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  27.17 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  27.43 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  22.7 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  28.98 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  27.16 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  24.46 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  28.3 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  29.25 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  23.5 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  26.26 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  26.95 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  30.67 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  26.75 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  26.78 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  28.83 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  28.83 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  28.83 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  27.89 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  28.83 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  26.75 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  28.67 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  28.95 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  26.76 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  24.28 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  29.25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  26.42 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  26.75 
 
 		 295 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  29.25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  23.26 
 
 		 198 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  26.42 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  24.72 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  26.34 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  26.11 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  28.44 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  21.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  23.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  24.39 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  27.37 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  28.07 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  26.51 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  23.53 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  26.34 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  27.78 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  27.89 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  27.62 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  22.22 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  26.92 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  28.07 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  27.21 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  29.82 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  26.54 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  24.14 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  27.01 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  26.35 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  27.71 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  25.42 
 
 		 284 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  26.67 
 
 		 284 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  26.67 
 
 		 284 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  24.49 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  24.06 
 
 		 796 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  25.42 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  26.67 
 
 		 284 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  25.23 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  26.15 
 
 		 879 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  25.76 
 
 		 286 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  26.15 
 
 		 879 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  29.01 
 
 		 295 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>