174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5762 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7015  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  75.42 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.83 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156733  normal  0.417355 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.67 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.744269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0741  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.25 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5598  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.8 
 
 		 239 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118165 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.3 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6918  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.95 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5879  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.26 
 
 		 255 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5837  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.88 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.48 
 
 		 219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  45.11 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  41.74 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  40.87 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.92 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  44.05 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  42.55 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  42.55 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.13 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.36 
 
 		 384 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  41.28 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4307  cyclic nucleotide-binding protein  39.57 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0784  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.88 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  39.66 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  44.35 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6128  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.61 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  40.17 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  40.17 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4306  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.3 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  35.24 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.52 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.25 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  34.93 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  32.47 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  33.04 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2958  cyclic nucleotide-binding  33.63 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2486  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  30.57 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  37.02 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.73 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.84 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  32.3 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3464  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.42 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0401211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  32.61 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2703  cyclic nucleotide-binding protein  33.01 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  30.94 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4966  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.916319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>