More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5661 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5661  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
474 aa  947    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434988 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7487  nodulation protein T precursor  52.4 
 
 
490 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05806  putative outer membrane lipoprotein  46.09 
 
 
490 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.19 
 
 
476 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2969  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.11 
 
 
521 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0473901 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  38.57 
 
 
522 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2135  putative outer membrane channel lipoprotein  42.99 
 
 
483 aa  293  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0693732  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.24 
 
 
525 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4106  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.2 
 
 
485 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0438089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.24 
 
 
525 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.53 
 
 
480 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.22 
 
 
484 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3900  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.16 
 
 
488 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362136  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.58 
 
 
483 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.58 
 
 
498 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.12 
 
 
509 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.69 
 
 
493 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.4 
 
 
518 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  32.22 
 
 
504 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.59 
 
 
480 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  30.18 
 
 
483 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.94 
 
 
477 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  31.81 
 
 
503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.92 
 
 
477 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.33 
 
 
501 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.43 
 
 
475 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  30.98 
 
 
491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.02 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.58 
 
 
486 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.99 
 
 
497 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.38 
 
 
489 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  28.64 
 
 
489 aa  170  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.11 
 
 
489 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  28.64 
 
 
479 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.81 
 
 
486 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  32.71 
 
 
520 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6558  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.67 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1481  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.54 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.290116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  30.56 
 
 
479 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 
482 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.8 
 
 
493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4060  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.68 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 
486 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
514 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
498 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
514 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
498 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
498 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
498 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.51 
 
 
493 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.17 
 
 
478 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
495 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 
477 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.25 
 
 
514 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.63 
 
 
486 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.25 
 
 
514 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.31 
 
 
505 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.85 
 
 
515 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  29.18 
 
 
569 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4671  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.71 
 
 
464 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.91 
 
 
482 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6074  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.4 
 
 
464 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5710  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.4 
 
 
464 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.92 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.23 
 
 
527 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.08 
 
 
481 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  30.61 
 
 
492 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  27.84 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.04 
 
 
483 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.97 
 
 
500 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.18 
 
 
516 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.16 
 
 
495 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.79 
 
 
511 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.35 
 
 
485 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  29.17 
 
 
487 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.72 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.21 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  27.98 
 
 
547 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  27.63 
 
 
485 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  27.42 
 
 
485 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.85 
 
 
498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.85 
 
 
498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.3 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  27.63 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.18 
 
 
497 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.02 
 
 
501 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.16 
 
 
498 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.94 
 
 
477 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.49 
 
 
507 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.69 
 
 
507 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  27.08 
 
 
485 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 
465 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.04 
 
 
481 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  27.42 
 
 
485 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.18 
 
 
486 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.62 
 
 
510 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  27.12 
 
 
479 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  26.27 
 
 
502 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.39 
 
 
457 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>