180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5652 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5652  porin  100 
 
 
207 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  51.27 
 
 
215 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70273e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  49 
 
 
212 aa  155  5e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  38.5 
 
 
213 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  38.28 
 
 
201 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  37.26 
 
 
213 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  37.39 
 
 
229 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  36.97 
 
 
205 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  33.78 
 
 
230 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  33.78 
 
 
230 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  36.97 
 
 
204 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  35.34 
 
 
228 aa  111  7e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  38.14 
 
 
212 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  35.68 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  34.91 
 
 
236 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  41.67 
 
 
211 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0892e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  42.68 
 
 
239 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  36.61 
 
 
228 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  36.61 
 
 
228 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  42.19 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  1.66827e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  40.45 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  33.33 
 
 
237 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  30.34 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.05 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  34.86 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  36.92 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.95 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.42 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.99 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.45 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  34.36 
 
 
250 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.88 
 
 
244 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  28.24 
 
 
261 aa  84.3  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  34.2 
 
 
236 aa  83.2  3e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  34.6 
 
 
234 aa  82.4  4e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.38 
 
 
206 aa  82.8  4e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  33.78 
 
 
251 aa  82.4  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.14 
 
 
206 aa  81.3  1e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  32.17 
 
 
237 aa  80.5  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  35.75 
 
 
212 aa  79.3  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.6 
 
 
225 aa  79.3  4e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32 
 
 
207 aa  78.6  6e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  26.67 
 
 
300 aa  78.6  6e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.76 
 
 
236 aa  78.2  7e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.56 
 
 
283 aa  78.2  7e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  35.6 
 
 
212 aa  78.2  8e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  32.86 
 
 
209 aa  77.4  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  35.6 
 
 
212 aa  77.4  1e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.33 
 
 
207 aa  77  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.77 
 
 
236 aa  77  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.73 
 
 
207 aa  77  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.43 
 
 
258 aa  76.3  3e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  29.39 
 
 
225 aa  75.9  4e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  33.65 
 
 
232 aa  74.7  9e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  31.49 
 
 
237 aa  74.7  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  31.9 
 
 
274 aa  74.3  1e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  33.48 
 
 
240 aa  73.9  2e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.98 
 
 
212 aa  73.6  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  34.93 
 
 
245 aa  73.2  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  32.2 
 
 
254 aa  73.2  3e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  32.17 
 
 
708 aa  73.2  3e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  31.55 
 
 
453 aa  72.4  4e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  28.85 
 
 
255 aa  72.8  4e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.67 
 
 
207 aa  71.2  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  32.47 
 
 
274 aa  71.2  1e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.05 
 
 
237 aa  70.5  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  32.47 
 
 
274 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.65 
 
 
240 aa  70.5  2e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  37.61 
 
 
284 aa  70.1  2e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  33.5 
 
 
703 aa  69.7  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  32.7 
 
 
703 aa  68.9  5e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  34.48 
 
 
238 aa  67.4  1e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  31.05 
 
 
245 aa  67.4  1e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  31.58 
 
 
206 aa  66.6  2e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.7 
 
 
452 aa  66.6  3e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  33.33 
 
 
241 aa  66.2  3e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.16 
 
 
250 aa  66.2  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  26.67 
 
 
281 aa  66.6  3e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  30.99 
 
 
243 aa  66.2  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  32.54 
 
 
703 aa  66.6  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  31.2 
 
 
447 aa  65.9  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.25 
 
 
997 aa  66.2  4e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.94 
 
 
248 aa  65.9  5e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  28.32 
 
 
230 aa  65.5  6e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  34.45 
 
 
242 aa  64.7  8e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  34.38 
 
 
578 aa  64.7  9e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.07 
 
 
283 aa  62.4  5e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  33.02 
 
 
246 aa  61.2  1e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  32.32 
 
 
241 aa  61.2  1e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.36 
 
 
243 aa  60.8  1e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  32.95 
 
 
207 aa  61.2  1e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  28.7 
 
 
652 aa  60.1  2e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  31.25 
 
 
638 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  29.11 
 
 
251 aa  59.7  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  27.44 
 
 
692 aa  57.4  1e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  30.58 
 
 
287 aa  58.2  1e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  29.57 
 
 
235 aa  57  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  30.96 
 
 
276 aa  57.4  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18187e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.24 
 
 
710 aa  56.6  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  29.15 
 
 
255 aa  55.8  4e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>