More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5634 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
371 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  38.6 
 
 
416 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  34.95 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  36.52 
 
 
432 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
392 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.12 
 
 
407 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.76 
 
 
418 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
413 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.59 
 
 
412 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  27.52 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  28.06 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.13 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  36.52 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  31.82 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.46 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.94 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.69 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  28.75 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.6 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.18 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
425 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  31.43 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.55 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  26.65 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  24.9 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.58 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.9 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.84 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  28.05 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.6 
 
 
420 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.82 
 
 
430 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  23.46 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  28.43 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.82 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  28.43 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  22.31 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  25.95 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  29.96 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.12 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  28.31 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.95 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  28.31 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
430 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.84 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  32.33 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.18 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  32.33 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  32.33 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  30.5 
 
 
456 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  29.74 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  29.74 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
437 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  30.6 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  29.74 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  29.74 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25 
 
 
443 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  28.78 
 
 
431 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
448 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  32.33 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  27.71 
 
 
442 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.36 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  30.17 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  26.64 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.67 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.16 
 
 
426 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  29.31 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.78 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.72 
 
 
431 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  30.77 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  30.77 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  30.22 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.59 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  25.93 
 
 
450 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
421 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  29.82 
 
 
451 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  30.17 
 
 
410 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
446 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.64 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  30.77 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  26.79 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>