More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5619 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
348 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  27.64 
 
 
305 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  28.28 
 
 
305 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  28.28 
 
 
305 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  28.19 
 
 
305 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  28.19 
 
 
305 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  28.19 
 
 
305 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  28.19 
 
 
305 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  27.33 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  27.93 
 
 
318 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  32.79 
 
 
296 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  28.19 
 
 
305 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3422  hypothetical protein  37.07 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
309 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.27 
 
 
304 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.94 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
306 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  26.37 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3675  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 
305 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  30.82 
 
 
326 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.46 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  30.25 
 
 
316 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  30.36 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  29.59 
 
 
304 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.3 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  28.71 
 
 
306 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  28.71 
 
 
306 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.46 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  28.31 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.31 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.46 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.88 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.88 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.88 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.46 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  29.93 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  31.47 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  31.27 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.88 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.73 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.22 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  25.25 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.22 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.61 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.12 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.71 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.22 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.43 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.43 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.43 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.24 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  24.75 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.43 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.74 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  30.93 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.43 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.41 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  27.86 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.05 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.51 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.71 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.05 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.34 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  28.12 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.97 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.05 
 
 
303 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.28 
 
 
328 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  28.52 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  33.01 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  27.86 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.38 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  22.64 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.91 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>