More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5612 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
763 aa  1557    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  70.72 
 
 
765 aa  1075    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  55.07 
 
 
397 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  51.34 
 
 
380 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  53.89 
 
 
380 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  51.7 
 
 
380 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  52.17 
 
 
381 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  50.52 
 
 
392 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  39.9 
 
 
383 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  40.75 
 
 
1293 aa  257  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  36.34 
 
 
402 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
378 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
364 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
384 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
373 aa  97.8  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.66 
 
 
365 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
379 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
339 aa  95.5  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
387 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
387 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
384 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
386 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
387 aa  92  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
381 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
364 aa  91.3  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  25 
 
 
424 aa  91.3  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.63 
 
 
404 aa  90.5  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
403 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
369 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
364 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
374 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
350 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
391 aa  88.6  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
379 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
404 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 
370 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
404 aa  87  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.77 
 
 
346 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
409 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
386 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
399 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
364 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.1 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.82 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
399 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
414 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
398 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
412 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
516 aa  82  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
394 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.47 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
821 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  33.14 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  25.45 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
773 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
362 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
443 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
389 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
382 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
443 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
495 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 
499 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
379 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.91 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
387 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
477 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.78 
 
 
411 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
369 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
379 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
512 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  30.66 
 
 
387 aa  79  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>