170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5610 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  71.56 
 
 
783 aa  1119    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
783 aa  1613    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  52.42 
 
 
814 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  68.51 
 
 
398 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  66.2 
 
 
393 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  65.48 
 
 
379 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  65.75 
 
 
393 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  63.4 
 
 
399 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  66.76 
 
 
390 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  61.35 
 
 
373 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  61.98 
 
 
377 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  59.62 
 
 
383 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  60.66 
 
 
372 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  58.84 
 
 
369 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  57.85 
 
 
363 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  51.79 
 
 
397 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  48.21 
 
 
420 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  49.3 
 
 
394 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  48.21 
 
 
394 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 
422 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  48.1 
 
 
373 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  48.78 
 
 
376 aa  332  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  43.21 
 
 
364 aa  331  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  46.36 
 
 
376 aa  330  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  48.52 
 
 
375 aa  329  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  46.09 
 
 
376 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  44.74 
 
 
386 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  46.24 
 
 
403 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.24 
 
 
1293 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 
382 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  46.38 
 
 
385 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  44.16 
 
 
404 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  44.65 
 
 
405 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  46.88 
 
 
369 aa  313  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  47.14 
 
 
412 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  41.84 
 
 
382 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  40.81 
 
 
391 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  41.44 
 
 
370 aa  299  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 
400 aa  292  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  41.54 
 
 
460 aa  277  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  41.24 
 
 
391 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  40.66 
 
 
381 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  41.94 
 
 
383 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  41.87 
 
 
384 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
415 aa  261  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  40.87 
 
 
389 aa  260  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  41.18 
 
 
395 aa  260  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  39.58 
 
 
395 aa  259  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  40.37 
 
 
395 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 
395 aa  256  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  40.38 
 
 
367 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  39.94 
 
 
365 aa  253  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  37.91 
 
 
394 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 
381 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 
383 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  40.77 
 
 
381 aa  251  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  39.46 
 
 
383 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  39.46 
 
 
383 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  39.45 
 
 
370 aa  249  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  39.84 
 
 
383 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  40.53 
 
 
395 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 
395 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  38.98 
 
 
366 aa  245  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  38.17 
 
 
380 aa  243  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  39.51 
 
 
367 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  38.79 
 
 
392 aa  243  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  38.83 
 
 
395 aa  241  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  37.82 
 
 
409 aa  240  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  37.25 
 
 
398 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  37.98 
 
 
368 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  39.3 
 
 
372 aa  238  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  38.44 
 
 
383 aa  238  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 
386 aa  238  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  36.58 
 
 
391 aa  237  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 
381 aa  237  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  37.74 
 
 
367 aa  237  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  40.16 
 
 
399 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  36.98 
 
 
399 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  37.31 
 
 
396 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  37.04 
 
 
402 aa  235  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  36.98 
 
 
413 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 
371 aa  234  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  35.7 
 
 
413 aa  233  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  40.27 
 
 
372 aa  233  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 
391 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  36.03 
 
 
428 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  36.05 
 
 
399 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.302478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  36.05 
 
 
399 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  36.65 
 
 
425 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  37.13 
 
 
370 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  34.92 
 
 
443 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  29.11 
 
 
388 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
398 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
389 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
385 aa  135  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
383 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  30.03 
 
 
443 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  34.88 
 
 
741 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  32.12 
 
 
392 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>