34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5519 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  100 
 
 
88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  69.88 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  70.89 
 
 
184 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  64.2 
 
 
94 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  55.42 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  58.97 
 
 
81 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  56.96 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  57.69 
 
 
81 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  49.33 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  53.23 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  43.84 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  49.37 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  45.95 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  42.86 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  42.67 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  52.86 
 
 
155 aa  66.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  45.59 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  42.65 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  45.59 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  41.67 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  42.47 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  38.36 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  39.13 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  34.94 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  35.71 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  36.92 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  31.43 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  35.21 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  33.85 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  38.46 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  47.37 
 
 
1314 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>