118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5357 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  85.53 
 
 
154 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 
155 aa  167  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  54.73 
 
 
155 aa  164  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 
152 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 
153 aa  157  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
155 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 
162 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48.67 
 
 
172 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  51.68 
 
 
166 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
154 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 
155 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 
165 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  49.38 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 
174 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  52 
 
 
157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  52 
 
 
157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  52 
 
 
157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 
168 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  53.69 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
163 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 
155 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
324 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 
163 aa  130  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  48.68 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
162 aa  123  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
296 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
324 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 
289 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
333 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
341 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
303 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.93 
 
 
305 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34.51 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  33.08 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.22 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 
473 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 
136 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  40.79 
 
 
292 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.19 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
351 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  40 
 
 
343 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.69 
 
 
336 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
356 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  34.19 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
230 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  34.19 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  34.19 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  34.19 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  33.04 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  35 
 
 
303 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  30.99 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  28.68 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.94 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  61.11 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.53 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  36.76 
 
 
142 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
174 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
326 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>