More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5352 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1105    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  95.59 
 
 		 544 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  71.08 
 
 		 547 aa  764    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  56.07 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  56.58 
 
 		 549 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  49.01 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 		 609 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  48.35 
 
 		 542 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  48.21 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 625 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.25 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  48.23 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  48.7 
 
 		 542 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 		 623 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  47.45 
 
 		 623 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  48.03 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  47.97 
 
 		 613 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 		 637 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  48.88 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  49.81 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  47.32 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 633 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.86 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 		 627 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  47.74 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  49.63 
 
 		 552 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.43 
 
 		 626 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 623 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  46.38 
 
 		 615 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  47.38 
 
 		 543 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 623 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  46.95 
 
 		 573 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 623 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  46.09 
 
 		 624 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.22 
 
 		 612 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 623 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.76 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.22 
 
 		 612 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.91 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.23 
 
 		 633 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  47.65 
 
 		 543 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.14 
 
 		 632 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.69 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  45.8 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  47.46 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  46.72 
 
 		 542 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.37 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  48.31 
 
 		 543 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 632 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.25 
 
 		 612 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.94 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.98 
 
 		 640 aa  475  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.94 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 623 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 625 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  47.18 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.22 
 
 		 553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 		 649 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.37 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  46.26 
 
 		 611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.84 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  48.96 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 536 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  49.14 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  50 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  46.33 
 
 		 537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  45.76 
 
 		 597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.5 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.56 
 
 		 617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  47.34 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  46.05 
 
 		 542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  47.21 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 633 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 		 623 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.3 
 
 		 627 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  46.33 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.75 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  46.33 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  46.59 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.79 
 
 		 643 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.01 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  47.16 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.35 
 
 		 543 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  42.65 
 
 		 617 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 		 634 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>