More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5320 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  84.68 
 
 		 346 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  84.97 
 
 		 346 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  80.36 
 
 		 353 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  80.06 
 
 		 353 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  76.29 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  44.29 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  48.92 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  48.92 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  47.19 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  47.45 
 
 		 381 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  47.45 
 
 		 381 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  52.02 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  48.31 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  46.92 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  49.39 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  43.22 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.86 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  41.54 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  45 
 
 		 835 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  42.22 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  41.18 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.97 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  44.97 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.25 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  43.35 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  43.35 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  43.35 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  43.35 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  43.35 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.65 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  42.54 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  40.61 
 
 		 322 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.12 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  42.09 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.12 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.57 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.71 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.71 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.27 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.39 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  40.52 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.3 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.51 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.16 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.16 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.16 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.48 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.27 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.83 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  39.21 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.83 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 310 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.64 
 
 		 334 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  37.32 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.37 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>