More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5253 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  90.23 
 
 		 215 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  32.19 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.82 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.3 
 
 		 589 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.9 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 270 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.09 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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