More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5220 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  86.22 
 
 		 313 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.2 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.58 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  34.04 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  34.04 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  34.04 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  34.04 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  34.04 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  32.99 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  32.65 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  32.65 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  32.65 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  32.65 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  32.65 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  30.69 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  30.34 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.53 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.6 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  29.77 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.04 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.09 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  30.48 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  29.45 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  31.42 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.35 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  30.97 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.75 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  30.8 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  24.82 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  31.2 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  24 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  30.6 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.57 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.39 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.24 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  32.33 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  25.9 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.21 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.74 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.43 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.74 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.83 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.57 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.74 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.74 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  29.75 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.74 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.66 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  26.42 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  27.31 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  26.77 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.81 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  25.61 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  29.25 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.24 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  32.03 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  25.72 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  21.63 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  30.55 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  21.28 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  29.33 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  30.98 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  26.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.36 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.67 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.54 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.45 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.78 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  44.3 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  45.56 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  27.9 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41900  predicted protein  30.34 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0459054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  27.33 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36777  predicted protein  30.34 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282056  normal  0.0125409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  27.33 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.18 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.26 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  29.67 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.71 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  26.56 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>