More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5177 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  94.94 
 
 		 237 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  42.04 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  39.38 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  38.36 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  36.04 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  35.81 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  34.96 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.89 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.44 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4644  GntR domain-containing protein  40.27 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.028465  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  31.76 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  32.89 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  31.36 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  32.64 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  37.61 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  37.61 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.51 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.88 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  31.82 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  34.98 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 253 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  31.96 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  30.18 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.65 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  37.67 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 268 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.9 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 255 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  39.18 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  38.82 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  32.44 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  37.42 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.92 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.42 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.84 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.53 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  32.74 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  29.58 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>