More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5124 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.14 
 
 		 516 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  81.18 
 
 		 507 aa  835    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.73 
 
 		 502 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 510 aa  1021    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1982  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.35 
 
 		 262 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  73.97 
 
 		 260 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  62.61 
 
 		 243 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  61.57 
 
 		 245 aa  302  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  60.92 
 
 		 247 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  60.5 
 
 		 247 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  60.5 
 
 		 247 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.21 
 
 		 598 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2483  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.96 
 
 		 254 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000249408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.34 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.64 
 
 		 602 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 		 592 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.82 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.64 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  61.64 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.64 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  61.21 
 
 		 249 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6339  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.27 
 
 		 265 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 		 595 aa  289  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 		 597 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.16 
 
 		 594 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.08 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.79 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 		 594 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 		 500 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.47 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 242 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 242 aa  276  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  56.3 
 
 		 256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.56 
 
 		 242 aa  273  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.12 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  57.56 
 
 		 242 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 244 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.23 
 
 		 246 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.79 
 
 		 567 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.07 
 
 		 244 aa  270  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  269  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 		 559 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 258 aa  269  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 246 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.68 
 
 		 268 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.93 
 
 		 240 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.39 
 
 		 240 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  52.81 
 
 		 257 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 241 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  53.75 
 
 		 269 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.5 
 
 		 247 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 240 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 240 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 241 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  53.59 
 
 		 255 aa  263  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.76 
 
 		 255 aa  263  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  57.55 
 
 		 265 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 251 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 269 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  56.14 
 
 		 243 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  55.97 
 
 		 248 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.27 
 
 		 252 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  52.5 
 
 		 257 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  56.78 
 
 		 243 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.97 
 
 		 249 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.22 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  52.5 
 
 		 257 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 263 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.78 
 
 		 242 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 249 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 244 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 244 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 240 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 240 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.88 
 
 		 249 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.81 
 
 		 240 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 253 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.72 
 
 		 246 aa  259  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>