More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4953 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
518 aa  1051    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.56 
 
 
520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  53.59 
 
 
518 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  53.4 
 
 
518 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  62.56 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  63.98 
 
 
225 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.64 
 
 
546 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.64 
 
 
546 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.89 
 
 
549 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.54 
 
 
545 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.54 
 
 
545 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.54 
 
 
545 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.66 
 
 
536 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  30.61 
 
 
539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.11 
 
 
509 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.79 
 
 
570 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.03 
 
 
361 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 
501 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.91 
 
 
562 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.55 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.29 
 
 
344 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  68.38 
 
 
118 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.21 
 
 
441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.34 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.51 
 
 
378 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  40.31 
 
 
229 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.23 
 
 
476 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.06 
 
 
297 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3937  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  28.27 
 
 
327 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  36.05 
 
 
284 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2277  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.717235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0739  hypothetical protein  45.54 
 
 
188 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  36.07 
 
 
122 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4147  hypothetical protein  53.52 
 
 
121 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530986  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  28.64 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  28.64 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  28.18 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.95 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  50.7 
 
 
83 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.02 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.4 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.4 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.89 
 
 
391 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1566  hypothetical protein  24.9 
 
 
382 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0196  hypothetical protein  23.33 
 
 
277 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  26.29 
 
 
418 aa  64.3  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  24.16 
 
 
457 aa  63.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.69 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3978  transposase  38.1 
 
 
107 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.719199  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.69 
 
 
408 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.69 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.69 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  25.53 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  23.74 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  23.78 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  23.78 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  23.78 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  23.78 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  23.74 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  26.05 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  26.05 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  23.74 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.69 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  26.05 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  26.05 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  26.05 
 
 
442 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  25.93 
 
 
237 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  43.21 
 
 
89 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  22.48 
 
 
418 aa  60.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.65 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1530  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  26.05 
 
 
146 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.36 
 
 
396 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.36 
 
 
396 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.36 
 
 
396 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.36 
 
 
396 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  27.78 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  28.49 
 
 
198 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.88 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.88 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.88 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  25.11 
 
 
296 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  27.78 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3384  hypothetical protein  43.86 
 
 
180 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>