More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4948 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.98 
 
 
232 aa  211  6e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  47.69 
 
 
219 aa  195  4e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  46.92 
 
 
217 aa  194  8e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  46.48 
 
 
219 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  46.01 
 
 
217 aa  181  5e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.62 
 
 
219 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  45.83 
 
 
225 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  42.99 
 
 
222 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  43.44 
 
 
229 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  43.12 
 
 
231 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  40.99 
 
 
230 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  41.4 
 
 
229 aa  165  6e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.74 
 
 
229 aa  163  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.89 
 
 
228 aa  163  2e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  43.9 
 
 
228 aa  162  4e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  43.9 
 
 
228 aa  162  4e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  46.35 
 
 
223 aa  162  5e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.2 
 
 
229 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
245 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.98 
 
 
228 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  43.18 
 
 
230 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.39 
 
 
231 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  39.07 
 
 
242 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  41.38 
 
 
223 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  41.38 
 
 
223 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  40.69 
 
 
223 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
228 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  38.99 
 
 
230 aa  146  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
223 aa  145  4e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  41.52 
 
 
230 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  41.85 
 
 
228 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  41.12 
 
 
224 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.65 
 
 
231 aa  140  1e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  38.07 
 
 
252 aa  140  1e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  40.43 
 
 
237 aa  140  1e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  42.39 
 
 
228 aa  139  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  41.74 
 
 
216 aa  140  2e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  41.85 
 
 
228 aa  139  5e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  38.97 
 
 
228 aa  139  5e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  43.75 
 
 
218 aa  137  9e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
228 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
260 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  36.53 
 
 
240 aa  134  1e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  36.74 
 
 
218 aa  134  2e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.68 
 
 
229 aa  133  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
240 aa  132  4e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  38.28 
 
 
255 aa  132  4e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  39.29 
 
 
235 aa  132  4e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.19 
 
 
229 aa  131  7e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  37.74 
 
 
240 aa  130  1e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  37.98 
 
 
228 aa  130  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
244 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
233 aa  130  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
244 aa  130  2e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  38.6 
 
 
208 aa  129  5e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.59 
 
 
233 aa  128  7e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 
229 aa  127  9e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
232 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  37.67 
 
 
232 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  37.21 
 
 
232 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  37.21 
 
 
232 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  37.21 
 
 
232 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  37.21 
 
 
232 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.05 
 
 
232 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
227 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  36.97 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.32 
 
 
240 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.9 
 
 
226 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.03 
 
 
223 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.27 
 
 
214 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  37.09 
 
 
232 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  36.76 
 
 
224 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  36.92 
 
 
230 aa  121  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  36.77 
 
 
229 aa  121  1e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
232 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 
237 aa  120  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 
246 aa  120  2e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  36.49 
 
 
225 aa  119  4e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
230 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 
248 aa  117  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
240 aa  117  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  41.12 
 
 
242 aa  116  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  40.89 
 
 
204 aa  117  2e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
230 aa  115  4e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  40.65 
 
 
242 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
237 aa  115  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  40.65 
 
 
242 aa  115  4e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
237 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
237 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
237 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
228 aa  114  9e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>