286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4780 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
415 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  79.23 
 
 
414 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  71.08 
 
 
437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  63.95 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  60.9 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2575  allantoate amidohydrolase  59.31 
 
 
416 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124568  normal  0.390769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  49.5 
 
 
415 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  50.24 
 
 
423 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  48.66 
 
 
414 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  49.63 
 
 
414 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.53 
 
 
427 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.48 
 
 
421 aa  309  8e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 
425 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  40.24 
 
 
416 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  42.16 
 
 
426 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  42.09 
 
 
426 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  42.58 
 
 
426 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  42.09 
 
 
426 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  41.71 
 
 
426 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 
426 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  41.85 
 
 
426 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  41.85 
 
 
426 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  41.85 
 
 
426 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  40.44 
 
 
411 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
418 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
418 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 
418 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  38.82 
 
 
416 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  41.87 
 
 
423 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 
421 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
418 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 
417 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 
419 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 
409 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  40.68 
 
 
416 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  39.85 
 
 
408 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  37.78 
 
 
417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 
423 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  41.56 
 
 
423 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
419 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  39.8 
 
 
420 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 
419 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  41.22 
 
 
479 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
425 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
425 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 
415 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  41.22 
 
 
427 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  38.57 
 
 
424 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 
425 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  42.62 
 
 
412 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  41.02 
 
 
407 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  41.22 
 
 
471 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  39.7 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.42 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  41.11 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.42 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  39.61 
 
 
416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.12 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  38.02 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  42.86 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  40.75 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.49 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  40.75 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  39.26 
 
 
418 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.9 
 
 
412 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 
416 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  41.09 
 
 
427 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  39.66 
 
 
423 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.83 
 
 
418 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
425 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  38.9 
 
 
427 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.8 
 
 
415 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  40.64 
 
 
424 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
425 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  42.09 
 
 
418 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  40.78 
 
 
407 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  40.78 
 
 
407 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.56 
 
 
407 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.24 
 
 
426 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  39.71 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  40.94 
 
 
427 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  40.53 
 
 
407 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  38.37 
 
 
420 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.31 
 
 
430 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  37.99 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  37.04 
 
 
421 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  38.82 
 
 
411 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  42.75 
 
 
429 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
415 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.35 
 
 
422 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  42.5 
 
 
429 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  41.71 
 
 
420 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>