More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4767 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  89.64 
 
 
252 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  62.5 
 
 
247 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  51.77 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  47.64 
 
 
244 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  44.05 
 
 
239 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  41.74 
 
 
235 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  42.67 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  44.74 
 
 
223 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  42.29 
 
 
239 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  43.44 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  44.39 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  44.39 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  44.39 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  42.99 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  42.99 
 
 
234 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  41.36 
 
 
245 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  43.72 
 
 
233 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  43.24 
 
 
240 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
240 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.82 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.55 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  42.79 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.98 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  42.79 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.5 
 
 
258 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.13 
 
 
264 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.13 
 
 
264 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.13 
 
 
264 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.08 
 
 
258 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  37.44 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  36.97 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  38.32 
 
 
247 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  38.32 
 
 
247 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  38.32 
 
 
247 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 
245 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.67 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
252 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.03 
 
 
245 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.63 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.21 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  36.89 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  36.21 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.21 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.21 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.21 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  36.89 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  35.4 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.89 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  38.94 
 
 
253 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  37.24 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 
255 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
255 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
250 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
256 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.48 
 
 
257 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
251 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.48 
 
 
257 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.48 
 
 
257 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.48 
 
 
257 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  36.05 
 
 
257 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  36.05 
 
 
257 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  36.05 
 
 
257 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.05 
 
 
257 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  35.02 
 
 
255 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.05 
 
 
257 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  36.97 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  37.92 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  37.76 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  40.07 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  38.84 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  38.84 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  38.75 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  38.84 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  36.78 
 
 
255 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  39.25 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.78 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
257 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.43 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  36.8 
 
 
231 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
255 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
249 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  34.77 
 
 
260 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>