222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4738 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  89.76 
 
 
254 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  74.8 
 
 
251 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  72.4 
 
 
251 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  65.99 
 
 
250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  64.9 
 
 
250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  66.93 
 
 
251 aa  331  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  61.54 
 
 
251 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  65.31 
 
 
251 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  60.89 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  61.07 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  63.82 
 
 
251 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.37 
 
 
251 aa  297  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  57.49 
 
 
251 aa  291  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  57.49 
 
 
251 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  57.49 
 
 
251 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  55.51 
 
 
273 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.12 
 
 
254 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  56.68 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  55.16 
 
 
252 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  55.06 
 
 
247 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.48 
 
 
258 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.48 
 
 
258 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  55.2 
 
 
250 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  55.92 
 
 
250 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  54.29 
 
 
247 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  53.66 
 
 
250 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  52.38 
 
 
255 aa  261  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  51.02 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.77 
 
 
251 aa  249  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  48.77 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  54.47 
 
 
402 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  53.06 
 
 
252 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  51.43 
 
 
254 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  51.43 
 
 
252 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  51.43 
 
 
252 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  55.41 
 
 
249 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.04 
 
 
249 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.76 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  44.94 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  44.94 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  48.77 
 
 
250 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  43.9 
 
 
246 aa  221  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  48.54 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.02 
 
 
246 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  41.53 
 
 
247 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  44.72 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  42.45 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  38.46 
 
 
247 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  36.84 
 
 
253 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  58.65 
 
 
137 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  44.76 
 
 
246 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  36.14 
 
 
249 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  36 
 
 
264 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.87 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.09 
 
 
251 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  35.08 
 
 
248 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  35.34 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  34.69 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.34 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.55 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.33 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  30.8 
 
 
244 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  32.74 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  32.88 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  29.92 
 
 
264 aa  92  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  32.88 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  29.6 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  25.78 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.27 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.79 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  28.67 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.85 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  32.41 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  29.09 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.66 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.83 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.57 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
459 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  27.98 
 
 
340 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  28.51 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
429 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
294 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>