More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4709 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
278 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.93 
 
 
278 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.46 
 
 
316 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
279 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
287 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
274 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
280 aa  185  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.36 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
275 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
277 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
275 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
275 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
291 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
291 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
274 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.13 
 
 
277 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
279 aa  178  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
273 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
292 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
288 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
293 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  38.4 
 
 
274 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
295 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
273 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
289 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
292 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
277 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
255 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
317 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11262  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugB  37.02 
 
 
274 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  36.12 
 
 
272 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.79 
 
 
289 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
277 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
277 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.88 
 
 
282 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
279 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
276 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
283 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
276 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
276 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
278 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
298 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
276 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
282 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
274 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
278 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
277 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
317 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
284 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
283 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0200189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
296 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
273 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
275 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
315 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
280 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
283 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114445  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  35.93 
 
 
277 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
286 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
281 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
253 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
280 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
271 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  33.21 
 
 
275 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2665  ABC sugar (glycerol) transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
267 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
288 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
319 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
316 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
276 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
267 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
281 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
283 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
271 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
283 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>