More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4690 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 524 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  42.06 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  40.23 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  39.88 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  39.46 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  39.96 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  40.59 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  39.54 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  39.53 
 
 		 533 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  38.84 
 
 		 522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  39.31 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.99 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 		 526 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  38.64 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  37.57 
 
 		 512 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 		 549 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  37.73 
 
 		 532 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  37.53 
 
 		 532 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  36.51 
 
 		 528 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 		 537 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 521 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.64 
 
 		 521 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 515 aa  286  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 		 528 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  33.99 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 526 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 526 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 526 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 524 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 		 531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 527 aa  243  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  32.05 
 
 		 528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  32.26 
 
 		 532 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.55 
 
 		 542 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 526 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  30 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  32.72 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 531 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 526 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.52 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 517 aa  219  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  29.18 
 
 		 517 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 523 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  29.19 
 
 		 595 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.39 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 505 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.48 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.92 
 
 		 535 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.27 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 517 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 509 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>