More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4609 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 154 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  94.16 
 
 		 154 aa  291  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  73.61 
 
 		 145 aa  231  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  65.54 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  200  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  62.59 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  66.43 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  66.9 
 
 		 145 aa  193  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  63.45 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  66.4 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 170 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.72 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.06 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.17 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 174 aa  97.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 171 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.89 
 
 		 187 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>