More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4560 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  88.93 
 
 
280 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  62.01 
 
 
284 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  61.29 
 
 
284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  61.68 
 
 
286 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  57.66 
 
 
280 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.68 
 
 
284 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
282 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
276 aa  287  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.34 
 
 
276 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 
280 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
276 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  54.38 
 
 
284 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  52.21 
 
 
278 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.74 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.24 
 
 
274 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.75 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
279 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
277 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
277 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  48.34 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
285 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 
274 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  49.07 
 
 
277 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 
274 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  47.83 
 
 
276 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
279 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
277 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
284 aa  236  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
279 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  45.26 
 
 
279 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
281 aa  235  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 
277 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
281 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.28 
 
 
290 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
280 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
286 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
293 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
281 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
282 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 
287 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
282 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
285 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 
276 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 
276 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 
275 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 
282 aa  222  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
279 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  45.61 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  43.54 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
283 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
293 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
277 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.98 
 
 
279 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  44.87 
 
 
283 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
279 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
280 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  41.83 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
275 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
283 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
282 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 
282 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
276 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
282 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
295 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
279 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
279 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
286 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
278 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
276 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
291 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
291 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
291 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
273 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
283 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
296 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
292 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
288 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
275 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>