More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4532 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  96.63 
 
 		 178 aa  351  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  79.78 
 
 		 178 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  76.37 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  90.07 
 
 		 151 aa  278  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  72.94 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  71.26 
 
 		 173 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  68.16 
 
 		 219 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  68.16 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  72.19 
 
 		 173 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  70.41 
 
 		 175 aa  244  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  91.67 
 
 		 132 aa  244  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  68.16 
 
 		 192 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  86.57 
 
 		 134 aa  238  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  86.57 
 
 		 134 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 		 173 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  61.26 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  64.13 
 
 		 194 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  64.13 
 
 		 194 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  67.84 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  66.67 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  66.08 
 
 		 173 aa  235  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  68.26 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  66.47 
 
 		 171 aa  231  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  70.41 
 
 		 173 aa  230  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  60.8 
 
 		 202 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 173 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 		 173 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  63.86 
 
 		 169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  72.92 
 
 		 145 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  69.82 
 
 		 173 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  60.95 
 
 		 173 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  65.93 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  75 
 
 		 132 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  73.48 
 
 		 132 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.9 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.9 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 		 180 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.07 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.07 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.07 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  67.67 
 
 		 137 aa  191  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  56.79 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 169 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  62.24 
 
 		 144 aa  188  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  55.77 
 
 		 159 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 177 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.25 
 
 		 154 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 182 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  55.19 
 
 		 174 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  55.19 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  58.54 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  51.48 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  56.29 
 
 		 154 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.21 
 
 		 155 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  50 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.3 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.29 
 
 		 238 aa  177  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.53 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  52.07 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  52.07 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  52.07 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>