135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4509 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  100 
 
 
411 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  92.21 
 
 
411 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  55.45 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  57.7 
 
 
431 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  54.96 
 
 
413 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  54.74 
 
 
415 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  55.12 
 
 
409 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  54.77 
 
 
407 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  54.88 
 
 
409 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  54.39 
 
 
409 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  52.24 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  53.07 
 
 
408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50.86 
 
 
420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  49.14 
 
 
433 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  53.05 
 
 
400 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  48.64 
 
 
433 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  49.01 
 
 
408 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  50 
 
 
407 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  49.27 
 
 
407 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  51.23 
 
 
406 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  48.05 
 
 
411 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  49.03 
 
 
407 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  49.51 
 
 
407 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  50.12 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  52.35 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  50.74 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  49.27 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  49.26 
 
 
411 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  49.51 
 
 
420 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  50.73 
 
 
407 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  52.83 
 
 
373 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  48.97 
 
 
410 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  47.92 
 
 
438 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  45.91 
 
 
413 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  44.94 
 
 
402 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  47.45 
 
 
444 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  43.73 
 
 
415 aa  329  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  43.98 
 
 
410 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  41.28 
 
 
409 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  45.73 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  44 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  44.09 
 
 
410 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  39.22 
 
 
419 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.24 
 
 
407 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.07 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.06 
 
 
408 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  33.5 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  33.5 
 
 
400 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.85 
 
 
421 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  33.9 
 
 
408 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  28.5 
 
 
418 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  32.68 
 
 
405 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.21 
 
 
416 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.21 
 
 
436 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  27.74 
 
 
409 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  31.45 
 
 
400 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.67 
 
 
409 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.29 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  26.13 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.13 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  27.25 
 
 
396 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  26.47 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.51 
 
 
391 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.12 
 
 
402 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.43 
 
 
406 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  27.09 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.52 
 
 
178 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  26.1 
 
 
406 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.57 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  23.53 
 
 
817 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  26.84 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  23.25 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  25.94 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.52 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.18 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.59 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.5 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.12 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.52 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  27.93 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  20.52 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  22.47 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.88 
 
 
277 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  20.9 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.28 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  23.96 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  32.71 
 
 
303 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  22.82 
 
 
310 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  23.13 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  21.77 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.28 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.28 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25.28 
 
 
333 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  23.32 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.18 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
282 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.78 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  25 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>