32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4505 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  100 
 
 
250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  67.46 
 
 
252 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  66.67 
 
 
252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  45.42 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  44.03 
 
 
242 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  38.37 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  45.05 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  44.55 
 
 
256 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  41.82 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  41.96 
 
 
221 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  42.27 
 
 
221 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  41.82 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  41.82 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  36.96 
 
 
270 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  40.91 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  50.92 
 
 
254 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  36.14 
 
 
255 aa  164  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  38.43 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  41.36 
 
 
259 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  34.48 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  32.89 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  33.83 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  33.83 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  33.33 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  34.76 
 
 
170 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  34.22 
 
 
170 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  34.22 
 
 
170 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  29.95 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1367  cephalosporin hydroxylase  26.49 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  28.95 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>