32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4503 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  100 
 
 
252 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  98.41 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  66.67 
 
 
250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  48.25 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  45.57 
 
 
244 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  48.17 
 
 
260 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  43.36 
 
 
259 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  46.33 
 
 
229 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  45.87 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  46.79 
 
 
259 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  38.31 
 
 
250 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  42.03 
 
 
221 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  40.58 
 
 
229 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  41.06 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  38.24 
 
 
270 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  40.1 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  40.1 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  49.35 
 
 
254 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  35.68 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  35.68 
 
 
210 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  35.68 
 
 
210 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  35.35 
 
 
191 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  36.18 
 
 
210 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  33.52 
 
 
170 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  34.07 
 
 
170 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  33.52 
 
 
170 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  27.4 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  34.78 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1367  cephalosporin hydroxylase  26.32 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>