More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4440 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  96.21 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  86.26 
 
 
211 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  86.26 
 
 
211 aa  377  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  75.98 
 
 
206 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  75.49 
 
 
206 aa  316  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  75.49 
 
 
206 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  76.14 
 
 
207 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  73.53 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  72.55 
 
 
208 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  72.06 
 
 
206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  71.08 
 
 
207 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 
207 aa  293  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 
212 aa  293  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 
212 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  65.69 
 
 
206 aa  292  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 
210 aa  292  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  68.14 
 
 
206 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  67.65 
 
 
212 aa  291  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 
207 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  70.56 
 
 
207 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 
207 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  65.69 
 
 
212 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  56.5 
 
 
213 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  56.28 
 
 
201 aa  215  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.73 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  55.21 
 
 
212 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  48.46 
 
 
253 aa  210  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.46 
 
 
249 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 
253 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
248 aa  204  8e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  49.13 
 
 
248 aa  203  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  49.34 
 
 
248 aa  203  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
247 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  53.16 
 
 
213 aa  201  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  45.81 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.93 
 
 
248 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  48.2 
 
 
229 aa  195  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  47.62 
 
 
249 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  47.58 
 
 
253 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 
228 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  46.75 
 
 
249 aa  191  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
228 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
228 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 
245 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  44.93 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  46.26 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  48.02 
 
 
250 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  47.89 
 
 
245 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
250 aa  188  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
293 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 
245 aa  187  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 
245 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
250 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
248 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
250 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  45.81 
 
 
247 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
250 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
250 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  44.78 
 
 
247 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  51.34 
 
 
204 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  44.35 
 
 
249 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 
245 aa  185  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
247 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  47.58 
 
 
250 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
250 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  47.42 
 
 
245 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
267 aa  185  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.37 
 
 
247 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  44.74 
 
 
247 aa  184  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
270 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
270 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  44.4 
 
 
237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  44.93 
 
 
251 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  44.93 
 
 
251 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>