288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4412 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  95.72 
 
 		 374 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  100 
 
 		 374 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  74.46 
 
 		 374 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  73.92 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  56.5 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  58.98 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  58.45 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  58.45 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  55.38 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  51.48 
 
 		 378 aa  352  7e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  50.27 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  49.73 
 
 		 382 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  50.14 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.87 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  49.86 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  50.27 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.07 
 
 		 385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  49.86 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  50 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  50.41 
 
 		 384 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  49.47 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  47.7 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  48.93 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  49.08 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  48.39 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  47.14 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  46.87 
 
 		 368 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  47.4 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  49.73 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  47.15 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  44.81 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  45.21 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  48.12 
 
 		 357 aa  263  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  44.79 
 
 		 369 aa  258  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  44.5 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  45.88 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  41.32 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  44.94 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.26 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  43.6 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  42.82 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  30.19 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  29.71 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  29.49 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  30.86 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.98 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.63 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  30 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  29.06 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  29.36 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.06 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  28.49 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.69 
 
 		 369 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.05 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  27.35 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.35 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  28.61 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  26.11 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  28.8 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  27.1 
 
 		 359 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  28.23 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  28.34 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  31.17 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  28.34 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.32 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  27.1 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  24.86 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  27.62 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.88 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  29.01 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  28.72 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  28.72 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  25.49 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  31.15 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.79 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.75 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  28.65 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.18 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00005  Recombinational DNA repair ATPase  26.65 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000571812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  28.46 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  26.2 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.37 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  27.5 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  28.38 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  26.68 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.19 
 
 		 401 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  26.2 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  27.49 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  28.53 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.78 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  28.53 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  28.53 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.13 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  27.57 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  27.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  27.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  27.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  27.57 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  27.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>