82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4388 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  96.54 
 
 
231 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  73.21 
 
 
231 aa  309  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  70.14 
 
 
240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  60.51 
 
 
200 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  59.49 
 
 
200 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  58.67 
 
 
217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  53.85 
 
 
211 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  44.85 
 
 
211 aa  161  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  42.06 
 
 
259 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  44.27 
 
 
264 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  42.71 
 
 
275 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  41.58 
 
 
234 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  37.61 
 
 
221 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  37.61 
 
 
221 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  39.13 
 
 
237 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  37.7 
 
 
234 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  34.8 
 
 
239 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  40.51 
 
 
249 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  38.86 
 
 
247 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  38.86 
 
 
247 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  42.64 
 
 
240 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  38.34 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  42.11 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  38.34 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  35.24 
 
 
221 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  38.97 
 
 
227 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  36.76 
 
 
263 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  36.41 
 
 
206 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  32.18 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  34.17 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  37.01 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  32.14 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  35.05 
 
 
205 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  34.8 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  34.8 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  29.17 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.93 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.93 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  33.5 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  29.9 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  30.32 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  34.55 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  29.44 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.5 
 
 
119 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  39.08 
 
 
92 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  27.61 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  31.91 
 
 
140 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  36.05 
 
 
120 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  37.31 
 
 
130 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  36.25 
 
 
96 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.13 
 
 
135 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  33.85 
 
 
96 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  34.29 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  27.85 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  27.85 
 
 
94 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  31.51 
 
 
90 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  30.14 
 
 
93 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  31.51 
 
 
90 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  36.25 
 
 
110 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 
79 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  28.92 
 
 
92 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  31.94 
 
 
107 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  30.14 
 
 
93 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  30.14 
 
 
93 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  30.14 
 
 
93 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0771  hypothetical protein  27.54 
 
 
193 aa  42  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  37.31 
 
 
103 aa  42  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>