More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4384 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  87.99 
 
 
283 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  50.75 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  50.78 
 
 
279 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  48.95 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 
280 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  39.75 
 
 
276 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  40.98 
 
 
270 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
270 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  38.4 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 
270 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
271 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  45.49 
 
 
233 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  45.06 
 
 
233 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
269 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
269 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
270 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
270 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
425 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
261 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
226 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
285 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  30.74 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  30.08 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  30.33 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
287 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.92 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.15 
 
 
284 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
259 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
327 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
282 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
284 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.71 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
277 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
261 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
277 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
276 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
275 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
267 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
277 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
265 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
326 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  25.75 
 
 
258 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
239 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
287 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.95 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  28.7 
 
 
247 aa  99  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.02 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  23.78 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.22 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
270 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.99 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
282 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  30.84 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.42 
 
 
260 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.42 
 
 
260 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  39.42 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.6 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  27.31 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  25.62 
 
 
380 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  25.22 
 
 
239 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  37.5 
 
 
265 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>