More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4355 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  65.41 
 
 
482 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.83 
 
 
482 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.4 
 
 
480 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.78 
 
 
482 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.03 
 
 
489 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.78 
 
 
482 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.57 
 
 
483 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.87 
 
 
480 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.82 
 
 
489 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.03 
 
 
489 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.83 
 
 
482 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.87 
 
 
480 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.41 
 
 
482 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  64.97 
 
 
494 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
500 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.28 
 
 
491 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.09 
 
 
486 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.03 
 
 
489 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.99 
 
 
480 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.77 
 
 
489 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.38 
 
 
509 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.03 
 
 
489 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.78 
 
 
482 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
489 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.99 
 
 
482 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.2 
 
 
482 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  94.52 
 
 
493 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.4 
 
 
480 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.98 
 
 
489 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.83 
 
 
482 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.4 
 
 
480 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  65.41 
 
 
482 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.41 
 
 
482 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.19 
 
 
492 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  999    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 
484 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.25 
 
 
489 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
489 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.03 
 
 
489 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
489 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.15 
 
 
483 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  66.03 
 
 
489 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.78 
 
 
493 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
489 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.77 
 
 
480 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
489 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.57 
 
 
492 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.78 
 
 
483 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 
493 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.51 
 
 
488 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
490 aa  633  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.52 
 
 
483 aa  631  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
488 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.29 
 
 
482 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  62 
 
 
485 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.1 
 
 
486 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.21 
 
 
485 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.29 
 
 
492 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.89 
 
 
486 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
493 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.05 
 
 
484 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  63.5 
 
 
480 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.14 
 
 
492 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.08 
 
 
482 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  65.2 
 
 
491 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
511 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
496 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  62.24 
 
 
482 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 
482 aa  621  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 
484 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
484 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
479 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
482 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 
479 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.06 
 
 
483 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.14 
 
 
482 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 
492 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2887  NADP(+) dependentsuccinate-semialdehyde dehydrogenase  67.3 
 
 
492 aa  609  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00129207  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6245  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.49 
 
 
490 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.584192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 
486 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.62 
 
 
486 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.14 
 
 
482 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
482 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
483 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
483 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.17 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.47 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.66 
 
 
484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
479 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.79 
 
 
480 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
486 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.89 
 
 
484 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  64.35 
 
 
480 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>