More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4290 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  50.24 
 
 
859 aa  790  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  69.54 
 
 
826 aa  1167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  70.76 
 
 
911 aa  1209  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  50.12 
 
 
837 aa  787  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  49.27 
 
 
858 aa  779  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
861 aa  1754  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 
843 aa  798  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  96.75 
 
 
861 aa  1604  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
830 aa  598  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
830 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
843 aa  583  1e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
857 aa  584  1e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  39.21 
 
 
838 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
837 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
842 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  41.66 
 
 
846 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  38.97 
 
 
824 aa  569  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
837 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
838 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  38.57 
 
 
903 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  39.39 
 
 
835 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
859 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
837 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
862 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
861 aa  532  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  37.45 
 
 
837 aa  453  1e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
829 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
801 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
770 aa  346  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
782 aa  328  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
798 aa  324  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
787 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
582 aa  166  1e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  34.96 
 
 
1046 aa  164  8e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
770 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
581 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
885 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.55 
 
 
565 aa  156  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  31.82 
 
 
736 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  29.43 
 
 
617 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  35.19 
 
 
603 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.34 
 
 
587 aa  154  9e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
1352 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  38.43 
 
 
508 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.34 
 
 
587 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
901 aa  153  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  37.05 
 
 
576 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
587 aa  153  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.91 
 
 
587 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
970 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
484 aa  151  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
383 aa  151  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
744 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  150  1e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.48 
 
 
587 aa  150  1e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  150  1e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  150  1e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1363 aa  149  2e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  149  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.10325e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1237 aa  149  2e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  33.57 
 
 
732 aa  149  2e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
778 aa  149  2e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  149  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
995 aa  148  4e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
568 aa  148  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
927 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
687 aa  147  7e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
585 aa  147  7e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.38 
 
 
537 aa  147  8e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
754 aa  147  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  36.03 
 
 
464 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
763 aa  146  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
442 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
442 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
620 aa  145  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
627 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.58 
 
 
1233 aa  145  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
1362 aa  145  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
575 aa  145  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
617 aa  144  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
371 aa  144  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1135 aa  144  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1070 aa  144  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
701 aa  144  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1070 aa  143  1e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  26.07 
 
 
790 aa  143  1e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
725 aa  143  1e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
844 aa  143  1e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.57 
 
 
1361 aa  143  1e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.13 
 
 
496 aa  143  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.09277e-05  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.62 
 
 
461 aa  142  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 
1301 aa  142  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  35.29 
 
 
988 aa  143  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.84 
 
 
1236 aa  142  2e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  35.29 
 
 
1014 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  35.29 
 
 
1032 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  26.65 
 
 
773 aa  142  2e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
456 aa  142  2e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
911 aa  143  2e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1207 aa  142  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>