More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4288 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  90.53 
 
 		 243 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  71.68 
 
 		 243 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  67.24 
 
 		 237 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  51.69 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  51.52 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  51.3 
 
 		 232 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  49.78 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  47.19 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  48.51 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  46.32 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  46.84 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  47.68 
 
 		 245 aa  214  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  47.3 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  50.21 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  45.96 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  48.07 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  45.34 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  44.73 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  47.3 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  46.61 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  45.11 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  46.19 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  45.34 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  43.1 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  44.92 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  42.49 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  43.04 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  42.73 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  40.87 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  40.53 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 252 aa  151  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  40.34 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  33.91 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.51 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  31.51 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  31.12 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  35.02 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  34.58 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.36 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  32.49 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  31.36 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  32.93 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  29.25 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  32.46 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  32.51 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  32.65 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  32.51 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  32.51 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  29.15 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  34.36 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  30.93 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 311 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.37 
 
 		 221 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  32.16 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  32.16 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  31.74 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  32.16 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  32.29 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  28.26 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  29.75 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>