67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4287 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  46.15 
 
 
1042 aa  800    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  45.2 
 
 
1052 aa  796    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 
1064 aa  2106    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  45.1 
 
 
1052 aa  796    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  61.68 
 
 
1059 aa  1249    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  63.6 
 
 
1062 aa  1299    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  92.86 
 
 
1064 aa  1915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  40.06 
 
 
1047 aa  695    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  44.8 
 
 
1052 aa  822    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  38.19 
 
 
1047 aa  539  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  38.19 
 
 
1047 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  38.08 
 
 
1045 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  39.23 
 
 
1037 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.43 
 
 
1048 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  36.18 
 
 
1043 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  36.35 
 
 
1053 aa  509  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  38.44 
 
 
1040 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  35.93 
 
 
1049 aa  505  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  37.62 
 
 
1054 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  35.84 
 
 
1001 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  36.15 
 
 
1049 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  35.74 
 
 
1049 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  38.1 
 
 
1015 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  37 
 
 
1048 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  35.63 
 
 
1042 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  33.36 
 
 
1076 aa  456  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  36.25 
 
 
1018 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  34.87 
 
 
999 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.52 
 
 
977 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  32 
 
 
997 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  32.09 
 
 
997 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  32.81 
 
 
1016 aa  364  5.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  33.95 
 
 
1014 aa  363  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  34.39 
 
 
991 aa  360  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.24 
 
 
988 aa  357  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  31.27 
 
 
986 aa  343  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  32.15 
 
 
991 aa  333  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.43 
 
 
993 aa  302  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  30.14 
 
 
980 aa  300  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  36.08 
 
 
1000 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.21 
 
 
911 aa  154  8.999999999999999e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  35.62 
 
 
959 aa  140  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.55 
 
 
914 aa  138  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.11 
 
 
890 aa  109  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.48 
 
 
976 aa  93.2  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.29 
 
 
957 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.09 
 
 
962 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.41 
 
 
947 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.97 
 
 
781 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.85 
 
 
958 aa  59.3  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.27 
 
 
919 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.6 
 
 
957 aa  56.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  55.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  32.72 
 
 
846 aa  54.7  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.82 
 
 
991 aa  53.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.37 
 
 
989 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  22.22 
 
 
862 aa  51.6  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.29 
 
 
836 aa  51.6  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  22.75 
 
 
872 aa  51.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  39.53 
 
 
142 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  23.15 
 
 
779 aa  50.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  23.26 
 
 
994 aa  48.9  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  31.93 
 
 
299 aa  46.2  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.36 
 
 
911 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.27 
 
 
1048 aa  45.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 
1059 aa  44.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.78 
 
 
994 aa  44.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>