More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4206 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  100 
 
 
149 aa  304  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  99.32 
 
 
147 aa  297  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  74.66 
 
 
166 aa  226  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  75.91 
 
 
137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  64.14 
 
 
150 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  54.81 
 
 
159 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  57.14 
 
 
130 aa  147  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  51.75 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  62.26 
 
 
117 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  58.93 
 
 
143 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  58.65 
 
 
168 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  49.62 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  64.29 
 
 
128 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  62.24 
 
 
164 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  56.25 
 
 
156 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  57.01 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  55.36 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  49.62 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  48.78 
 
 
141 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  58.16 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  49.14 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  62.11 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  62.11 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  56.12 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  58.65 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  63.44 
 
 
109 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  53.57 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  45.45 
 
 
210 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  53.04 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  58.43 
 
 
99 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  51.04 
 
 
153 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  52.94 
 
 
135 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  59.55 
 
 
100 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  59.55 
 
 
100 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  53.4 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  55 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  48.18 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  47.92 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  55.81 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  50 
 
 
130 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  50.51 
 
 
112 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.59 
 
 
123 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  48.04 
 
 
226 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  42.72 
 
 
116 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  50.51 
 
 
112 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  43.27 
 
 
400 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  41 
 
 
118 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  44.57 
 
 
118 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  44.57 
 
 
105 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  45.45 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  46.94 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  42.72 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  44.44 
 
 
114 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  44.44 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  44.79 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  43.16 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  43.16 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  46.15 
 
 
105 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  39.81 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  39.81 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  39.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  41.75 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  40.78 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  40 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  39.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  47.25 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  42.57 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  39.58 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  45.05 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  41.67 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.45 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  43.75 
 
 
105 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  37.86 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.84 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.71 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  40.78 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  38.83 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  40.82 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  42.42 
 
 
117 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  41.58 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>