More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4180 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  96.53 
 
 
547 aa  1093    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  81.32 
 
 
546 aa  906    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  71.81 
 
 
543 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
547 aa  1120    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  65.7 
 
 
550 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  62.94 
 
 
569 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  59.88 
 
 
529 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  59.5 
 
 
538 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  54.85 
 
 
564 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  58.33 
 
 
529 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 
533 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  54.51 
 
 
533 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  53.57 
 
 
535 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  54.22 
 
 
533 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  53.14 
 
 
533 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.88 
 
 
535 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.85 
 
 
533 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  52.65 
 
 
533 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.08 
 
 
563 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 
489 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  52.68 
 
 
535 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  49.53 
 
 
528 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 
518 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  50.97 
 
 
533 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  48.69 
 
 
529 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 
529 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  50.49 
 
 
530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  50.49 
 
 
530 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  50.49 
 
 
530 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  50.49 
 
 
530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  50.49 
 
 
530 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  50.3 
 
 
530 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  51.21 
 
 
530 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  48.69 
 
 
529 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 
529 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 
529 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 
529 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  47.76 
 
 
543 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  47.82 
 
 
532 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 
537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  41.87 
 
 
531 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  40.93 
 
 
531 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 
529 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 
532 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 
529 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
547 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  39.4 
 
 
522 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 
522 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 
522 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  39.39 
 
 
536 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  38.04 
 
 
522 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 
536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  38.21 
 
 
536 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 
536 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
538 aa  347  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  39.65 
 
 
522 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  36.57 
 
 
540 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 
524 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 
538 aa  326  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  34.73 
 
 
534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
528 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  35.1 
 
 
531 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 
531 aa  296  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 
536 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 
523 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  34.54 
 
 
525 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 
515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
516 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
521 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.92 
 
 
516 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.01 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.02 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.83 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.83 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
566 aa  181  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.54 
 
 
516 aa  179  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
501 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
501 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
526 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
545 aa  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
532 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.08 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>