More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4163 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  97.28 
 
 
257 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  87.16 
 
 
257 aa  427  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  76.26 
 
 
257 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.54 
 
 
257 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.54 
 
 
257 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  77.82 
 
 
257 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  68 
 
 
256 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  65.48 
 
 
256 aa  344  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  69.96 
 
 
261 aa  338  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  61 
 
 
260 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  65.77 
 
 
260 aa  331  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  64.8 
 
 
255 aa  329  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  64.4 
 
 
255 aa  329  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  64.23 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  64.23 
 
 
260 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  63.71 
 
 
260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  63.71 
 
 
260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  63.71 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  60.48 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  251  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  251  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  48.37 
 
 
257 aa  249  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.25 
 
 
265 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  53.25 
 
 
265 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  52.81 
 
 
265 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  52.81 
 
 
265 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  52.81 
 
 
265 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  52.81 
 
 
265 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 
265 aa  248  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  51.27 
 
 
273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  43.58 
 
 
262 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 
259 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 
259 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  47.2 
 
 
250 aa  226  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  47.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  42.57 
 
 
259 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 
281 aa  222  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  43.9 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  45.69 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  48.52 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 
268 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  46.46 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.41 
 
 
503 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 
489 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  44.05 
 
 
489 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 
489 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.23 
 
 
503 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.61 
 
 
483 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  45.83 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  44.31 
 
 
268 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
266 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.02 
 
 
264 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  44.67 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  42.98 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.02 
 
 
264 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 
266 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  41.15 
 
 
264 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  43.36 
 
 
252 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  40.54 
 
 
264 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  42.15 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  42.15 
 
 
264 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.39 
 
 
266 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  40.96 
 
 
265 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  41.67 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.63 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.06 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
264 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
264 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
264 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.87 
 
 
266 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 
266 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 
266 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  40.77 
 
 
264 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  41.22 
 
 
270 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  40.08 
 
 
266 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  40.08 
 
 
266 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  40.08 
 
 
266 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  39.3 
 
 
266 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 
266 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 
266 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 
266 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.83 
 
 
267 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  38.37 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  37.8 
 
 
266 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>