More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4090 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  97 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  76.23 
 
 		 267 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  73.13 
 
 		 268 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  65.92 
 
 		 268 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  65.92 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  63.3 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  63.77 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  58.3 
 
 		 272 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  59.11 
 
 		 270 aa  328  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.56 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  56.25 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  57.36 
 
 		 268 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  55.19 
 
 		 269 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  55.56 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  55.19 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  53.7 
 
 		 270 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  57.04 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 		 269 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.43 
 
 		 293 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  54.98 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  55.06 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  53.31 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  54.44 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  52.96 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  55.64 
 
 		 261 aa  294  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  52.81 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  53.93 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  54.55 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  55.43 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  58.02 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  53.56 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  53.56 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  52.81 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  49.44 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  50.19 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  44.76 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  34.59 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  36.02 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  35.19 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  33.95 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  32.5 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  35.42 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  34.94 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  34.69 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  33.95 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  32.6 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  30.88 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  35.61 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  34.32 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  34.33 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  32.61 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.4 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  36.06 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  34.22 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  35.07 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  32.71 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  32.46 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  34.08 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  32.83 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  34.57 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  31.56 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.55 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  33.72 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  34.33 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  33.83 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  35.93 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  34.32 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  32.69 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  32.85 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  31.73 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  32.69 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  34.7 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  31.94 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  32.17 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  32.17 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  31.2 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  34.6 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.82 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>