More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4052 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  54.74 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  47.24 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  50.98 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  53.73 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  48.15 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  47.53 
 
 		 201 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  50.37 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  46.26 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  53.33 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.7 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  43.2 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.75 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 		 157 aa  131  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.95 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.72 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  48.63 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  47.02 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  47.55 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  45.57 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  45.14 
 
 		 141 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.87 
 
 		 453 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  47.79 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.78 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.52 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 		 157 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 		 154 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  47.55 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.78 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  41.78 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.78 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.78 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.78 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  47.76 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  46.27 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  42.58 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.87 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  47.76 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  47.83 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  46.85 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>