103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4050 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 130 aa  264  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  98.46 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  66.12 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  61.61 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  57.85 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  57.85 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  56.2 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  52.07 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  50.45 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  47.22 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  45.19 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  43.64 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  44 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  96.7  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  41.41 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  37.08 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  35.4 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  35.4 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  46.27 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  38.37 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  34.82 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  34.41 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  34.82 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  34.82 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  34.82 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  40.98 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  40.98 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  32.61 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  36.28 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  34.12 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  34.12 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  41.38 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  31.31 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  32.94 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  34.52 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  34.52 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  31.96 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  35.29 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  42.22 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  39.06 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  36.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  34.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  38.78 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  29.47 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  34.09 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  39.06 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  39.34 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  45.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  45.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  43.14 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  37.25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  31.11 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  31.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  43.64 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  43.9 
 
 		 148 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  43.64 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  36 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  43.9 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  43.14 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  43.14 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.89 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  36.11 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>