More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4047 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  81.49 
 
 
411 aa  690  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  81.75 
 
 
411 aa  692  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  83.74 
 
 
413 aa  727  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  94.62 
 
 
408 aa  804  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 
409 aa  845  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  78.82 
 
 
411 aa  692  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  78.26 
 
 
408 aa  660  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  83.9 
 
 
410 aa  727  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  77.72 
 
 
414 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  68.67 
 
 
399 aa  563  1e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  69.45 
 
 
398 aa  563  1e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  68.67 
 
 
399 aa  563  1e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  68.41 
 
 
399 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  67.89 
 
 
403 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  67.89 
 
 
397 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  69.21 
 
 
414 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  66.32 
 
 
427 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  64.45 
 
 
391 aa  538  1e-152  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  64.52 
 
 
425 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  63.4 
 
 
431 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  65.1 
 
 
425 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  64.84 
 
 
425 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  63.73 
 
 
399 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  63.4 
 
 
431 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  62.95 
 
 
399 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  61.07 
 
 
430 aa  507  1e-142  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  60.32 
 
 
391 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  62.23 
 
 
392 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  62.23 
 
 
392 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  61.68 
 
 
392 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  63.04 
 
 
410 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  58.1 
 
 
396 aa  468  1e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  59.74 
 
 
404 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  61.04 
 
 
406 aa  459  1e-128  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  55.14 
 
 
402 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  58.97 
 
 
428 aa  444  1e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  54.22 
 
 
429 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  55.11 
 
 
420 aa  441  1e-122  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  58.66 
 
 
397 aa  441  1e-122  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  57.18 
 
 
390 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  55.98 
 
 
404 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  55.36 
 
 
339 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  49.86 
 
 
356 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  48.13 
 
 
382 aa  337  2e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  47.86 
 
 
382 aa  336  4e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  48.13 
 
 
382 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  47.53 
 
 
366 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  49.18 
 
 
377 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  47.33 
 
 
379 aa  328  1e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  47.06 
 
 
378 aa  327  2e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  48.54 
 
 
376 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  47.59 
 
 
381 aa  325  8e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  47.59 
 
 
381 aa  325  8e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  47.59 
 
 
381 aa  325  8e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.55307e-08 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  45.99 
 
 
381 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  49.73 
 
 
382 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  47.33 
 
 
381 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.14748e-11 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  49.57 
 
 
383 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  46.79 
 
 
382 aa  322  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  48.42 
 
 
383 aa  321  2e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  48.4 
 
 
384 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  48.41 
 
 
384 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  47.65 
 
 
383 aa  320  4e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  49.01 
 
 
383 aa  320  4e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  48.24 
 
 
362 aa  319  4e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  48.73 
 
 
383 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  45.93 
 
 
403 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  44.83 
 
 
369 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  48.47 
 
 
382 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  46.03 
 
 
363 aa  312  7e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  46.03 
 
 
362 aa  312  7e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  50.45 
 
 
372 aa  311  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  47.5 
 
 
365 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  48.6 
 
 
379 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  48.6 
 
 
379 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  48.88 
 
 
378 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  48.6 
 
 
379 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  48.32 
 
 
379 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  48.32 
 
 
379 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  48.32 
 
 
379 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.98 
 
 
373 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  48.41 
 
 
382 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.19 
 
 
373 aa  309  7e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.19 
 
 
373 aa  309  7e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  44.76 
 
 
393 aa  308  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  44.76 
 
 
393 aa  308  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.19 
 
 
373 aa  308  1e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  48.86 
 
 
378 aa  308  1e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  46.97 
 
 
360 aa  308  1e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.86 
 
 
373 aa  308  1e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  44.99 
 
 
364 aa  307  2e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  46.11 
 
 
370 aa  306  4e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>