More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4029 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
177 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  98.86 
 
 
178 aa  352  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  87.5 
 
 
199 aa  317  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  83.52 
 
 
176 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  82.95 
 
 
176 aa  304  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  82.95 
 
 
176 aa  304  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  80.79 
 
 
178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  80.23 
 
 
177 aa  296  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  74.01 
 
 
177 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  74.14 
 
 
178 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  74.43 
 
 
179 aa  279  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  74.43 
 
 
179 aa  279  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  72.73 
 
 
181 aa  277  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  73.45 
 
 
180 aa  276  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  72.99 
 
 
176 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  74.71 
 
 
178 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  73.56 
 
 
178 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  74.14 
 
 
176 aa  275  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  73.71 
 
 
178 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  72.67 
 
 
181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  71.26 
 
 
178 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  71.02 
 
 
177 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  69.54 
 
 
177 aa  267  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  67.82 
 
 
179 aa  264  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  71.26 
 
 
177 aa  260  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  68 
 
 
175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  68 
 
 
176 aa  250  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  60.45 
 
 
178 aa  234  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  58.62 
 
 
179 aa  221  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  57.14 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  57.56 
 
 
182 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  57.06 
 
 
178 aa  209  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  55.37 
 
 
177 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0146  inorganic pyrophosphatase  56.74 
 
 
179 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  56 
 
 
175 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  56.98 
 
 
176 aa  208  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  55.43 
 
 
176 aa  207  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  55.43 
 
 
175 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  53.98 
 
 
176 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  54.29 
 
 
175 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  53.45 
 
 
175 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  53.98 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
176 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  55.68 
 
 
176 aa  204  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  54.65 
 
 
182 aa  203  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  55.23 
 
 
177 aa  201  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  53.41 
 
 
176 aa  201  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  201  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  201  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  51.7 
 
 
176 aa  201  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
175 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  54.8 
 
 
206 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  54.86 
 
 
175 aa  200  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
175 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
175 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  53.45 
 
 
175 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  51.7 
 
 
176 aa  197  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  53.45 
 
 
175 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  53.14 
 
 
175 aa  197  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  53.98 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  50.88 
 
 
176 aa  195  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  51.7 
 
 
182 aa  195  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  54.82 
 
 
173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  54.82 
 
 
173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  52.33 
 
 
178 aa  194  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  52.33 
 
 
175 aa  194  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  52.87 
 
 
175 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  52.27 
 
 
176 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  52.33 
 
 
178 aa  192  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  50.57 
 
 
178 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  50.57 
 
 
178 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  53.53 
 
 
181 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  53.53 
 
 
181 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  52.27 
 
 
178 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  50.86 
 
 
174 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  50.85 
 
 
177 aa  191  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  51.15 
 
 
175 aa  190  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  50.58 
 
 
182 aa  190  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  50.57 
 
 
178 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0608  inorganic pyrophosphatase  52.27 
 
 
177 aa  189  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0773758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>