More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3964 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.23 
 
 
467 aa  641  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.97 
 
 
470 aa  712  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.6 
 
 
467 aa  635  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.84 
 
 
468 aa  793  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
468 aa  936  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.16 
 
 
467 aa  644  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.74 
 
 
467 aa  651  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.02 
 
 
467 aa  640  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.63 
 
 
467 aa  755  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.95 
 
 
467 aa  649  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.3 
 
 
467 aa  639  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.81 
 
 
471 aa  753  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.02 
 
 
469 aa  650  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.23 
 
 
467 aa  639  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.06 
 
 
467 aa  757  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.08 
 
 
470 aa  635  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.38 
 
 
480 aa  650  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.31 
 
 
467 aa  640  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.58 
 
 
468 aa  910  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.19 
 
 
468 aa  804  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.44 
 
 
468 aa  702  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.02 
 
 
467 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.09 
 
 
466 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.24 
 
 
467 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.45 
 
 
466 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 
463 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.52 
 
 
581 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 
463 aa  570  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.95 
 
 
466 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 
468 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.8 
 
 
464 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  59.23 
 
 
464 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.09 
 
 
462 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.58 
 
 
462 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 
465 aa  539  1e-152  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.31 
 
 
462 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.1 
 
 
462 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.13 
 
 
466 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  56.96 
 
 
511 aa  518  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  54.51 
 
 
500 aa  515  1e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.64 
 
 
466 aa  518  1e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.73 
 
 
466 aa  516  1e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
462 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.99 
 
 
466 aa  506  1e-142  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.1 
 
 
465 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.48 
 
 
459 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.64 
 
 
466 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.79 
 
 
460 aa  495  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.89 
 
 
463 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  56.38 
 
 
504 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  55.77 
 
 
466 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 
466 aa  492  1e-138  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 
466 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 
466 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.82 
 
 
466 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.11 
 
 
468 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.07 
 
 
467 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.06 
 
 
462 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.09 
 
 
466 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.98 
 
 
467 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.99 
 
 
481 aa  468  1e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.6 
 
 
468 aa  466  1e-130  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.55 
 
 
470 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.02 
 
 
472 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.35 
 
 
467 aa  460  1e-128  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
479 aa  461  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.52 
 
 
470 aa  452  1e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.47 
 
 
477 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
476 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.28 
 
 
471 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  451  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 
475 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 
474 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
475 aa  446  1e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 
476 aa  447  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 
483 aa  447  1e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
481 aa  446  1e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
475 aa  448  1e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 
476 aa  447  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.95 
 
 
462 aa  447  1e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 
468 aa  446  1e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.54 
 
 
463 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 
476 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36951  FAD flavoprotein  53.74 
 
 
477 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.66 
 
 
475 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
478 aa  439  1e-122  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
475 aa  439  1e-122  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 
477 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 
484 aa  439  1e-122  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 
474 aa  440  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  441  1e-122  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 
478 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 
476 aa  441  1e-122  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.18 
 
 
476 aa  440  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 
478 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>