More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3934 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
278 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.28 
 
 
268 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.47 
 
 
288 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 
246 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
253 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
265 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  37.97 
 
 
265 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  37.55 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  37.55 
 
 
257 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  37.55 
 
 
265 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  37.55 
 
 
265 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
255 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
257 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
283 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
256 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40.93 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
272 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
272 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
260 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
272 aa  178  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
257 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
249 aa  168  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
250 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
259 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
222 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
257 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
254 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
254 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.86 
 
 
284 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
258 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
281 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
250 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
243 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.75 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
268 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  34.02 
 
 
250 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  31.56 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  34.84 
 
 
251 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  31.56 
 
 
266 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
251 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  33.61 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  33.61 
 
 
250 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  33.61 
 
 
250 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
247 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  33.61 
 
 
250 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
250 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
303 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
250 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
282 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  34.82 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
238 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
258 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
273 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  33.19 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
281 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
362 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
258 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
256 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
286 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  31.54 
 
 
287 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
267 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  34.04 
 
 
282 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  34.01 
 
 
288 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
316 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.505407  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3455  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
322 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
258 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
270 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>